基因组测序>
建库测序>
人类基因组测序>
动植物基因组测序>
微生物基因组测序>
转录调控测序>
表观组测序>
单细胞测序>
空间转录组>
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质谱分析>
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代谢组学分析>
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单细胞转录组测序
单细胞转录组测序—基于Smart扩增技术分析细胞转录组
单细胞转录组测序(Single cell RNA sequencing)是在单个至数百个细胞水平对mRNA进行高通量测序的一项技术,针对单个至数百个细胞研究其整体水平的基因表达情况,成功解决细胞分子 机制研究中常见的细胞量少而无法进行常规高通量测序等难题。高效,精准,无忧
单细胞转录组测序技术主要用于在全基因组范围内挖掘基因调控网络,尤其适用于存在高度异质性的干细胞、肿瘤细胞及胚胎发育早期应用方向
胚胎发育
人、小鼠、斑马鱼等胚胎细胞发育,干细胞增殖与分化研究。癌症疾病
肿瘤、精神疾病、代谢病、心血管病、免疫病等研究。生殖细胞
卵原细胞增殖与分化、增殖时期等研究。诺禾优势
1. 样本起始量低
1-1000个细胞/文库2. 项目经验丰富
2015年11月,Clontech认证诺禾致源为中国地区唯一单细胞转录组测序合作伙伴,诺禾致源已建立SMARTer ? v4 UltraTM Low Input RNA Kit for Sequencing方法的单细胞转录组测序体系。项目经验累积数万例。50天
项目周期500样品
并行分析PE150
测序读长≥80%
测序质量Q303. 方案设计专业,质控严格
从材料选取,建库测序,到数据分析,每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。材料选取
细胞样品
1-1000个新鲜细胞
文库构建
普通文库
PE150测序
6~12Gb
信息分析
4. 项目文章以及物种经验丰富
诺禾致源已经成功完成对包括人、大鼠、小鼠、斑马鱼、猪、牛、羊、鸡等十多个物种,生殖、胚胎、肿瘤、血液、淋巴、神经、心血管等不同组织来源,经多种单细胞分选方法得到 的近千例样本进行了扩增,经测序及数据分析后,已在Nature Structural & Molecular Biology杂志上发表高水平项目文章。80人
分析团队7年
项目经验1000+
结题项目1对1
项目服务信息分析
诺禾致源单细胞转录组测序项目,不仅包括基因的结构和基因表达水平的分析,还包括差异基因功能注释。此外,诺禾致源提供个性化分析的服务,可以根据客户需求定制分析内容。基因结构水平分析 | 基因表达水平分析 |
---|---|
数据质控 参考基因组比对 新转录本预测 基因结构优化 可变剪切事件分类 可变剪切数量统计 变异检测SNP/InDel分析 | 数据质量评估 基因表达水平分析 差异基因表达水平分析 差异基因GO/KEGG富集分析 差异基因蛋白互作网络分析 RNA-seq整体质量评估 可视化结果展示 |
送样建议
组织类型 | 送样建议 |
---|---|
新鲜动物细胞* | 1-1000个 |
Total RNA | >10 pg |
常见问题
1. 染色、FFPE等处理过的细胞是否能够进行单细胞转录组测序?
2. 细胞可以不用不含Mg 2+和Ca 2+的1×PBS溶液清洗,直接在原培养液中吸取样本吗?
3. 离心管在使用前需要进行预处理吗?
4. 样品取出后有规定在多少天之内送到公司吗?送之前是直接保存在-80℃的冰箱中吗?还需要其他处理吗?
5. 扩增是用什么方法呢?阴性对照和阳性对照是自己准备吗?
6. 多聚甲醛固定细胞后做单细胞转录组,会对细胞有什么影响?是会使RNA降解还是会影响扩增?还是其他原因?
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