伴随诊断一站式解决方案-产品介绍-诺禾致源

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肿瘤新抗原预测

肿瘤新抗原又称为肿瘤特异性抗原（Tumor-specificantigen，TSA），是由肿瘤细胞产生的体细胞突变，且仅表达于肿瘤细胞，有比较强的肿瘤特异性和较高的免疫原性。因为其诱导自身免疫疾病的风险较低，肿瘤新抗原为免疫治疗提供了新的方向，成为现阶段的研究热点。诺禾致源依托国际领先的测序平台及生物信息分析平台成功推出 NovoNeoantigen 肿瘤新抗原预测服务，通过对肿瘤组织与正常对照样本的全外显子组测序（WES）数据和肿瘤组织的转录组测序（mRNA-Seq）数据进行分析，实现对肿瘤新抗原的精准预测。

全面的结果分析

NovoNeoantigen 基于配对样本的全外显子组数据和肿瘤组织的 mRNA-seq 数据，对三种变异类型（SNV，InDel and Fusion）的变异结果进行进一步分析，并得到肿瘤突变负荷（TMB）、SNV phasing、HLA 分型和抗原亲和性的结果，最终筛选预测肿瘤特异性抗原。

可靠的性能验证

NovoNeoantigen 通过对已知基因突变引起的新抗原数据进行验证，保证可靠的数据分析。

极致的周期体验

NovoNeoantigen 可灵活提供两种交付周期：即从样本接收到分析结果的全流程服
务，只需 24 个工作日；从客户提供的原始数据到分析结果的纯分析服务，只需 6 个工作日。

产品参数

测序策略	NovaSeq 6000 , PE150
样本要求	• FFPE 切片：≥ 10 张 (4 μm)，单张面积 ≥ 25 mm² • FFPE 蜡块：≥ 1 块 • 新鲜组织：≥ 300 mg • 血液：≥ 2 ml
Raw Data 要求	• 全外显子组测序：肿瘤样本建议测序深度 ≥ 200 X 正常样本建议测序深度 ≥ 100 X • RNA 测序： FFPE 肿瘤样本测序数据量 ≥ 12 G 新鲜组织样本测序数据量 ≥ 9 G • 数据格式： FASTQ 和 BED 文件
交付周期	• 样本接收到交付分析结果：24 个自然日 • 原始数据到交付分析结果：6 个自然日

生信流程

● 通过 WES 数据分析准确预测所有的 HLA-I 型分子和 6 种 HLA-II 型分子（包括 DQA1, DQB1, DPA1, DPB1, DRB1, and DRB5）； ● 结合 WES 和 mRNA-Seq 数据检测 SNV、InDel 和 Fusion 三种变异类型和相应基因表达水平，同时在 SNV 预测的过程加入了 phasing 方法，提高预测灵敏度，并可提供TMB 的结果； ● 根据数据分析结果预测肿瘤特异性新抗原。