翻译组Ribo-seq

产品介绍结果展示案例解析常见问题


Ribo-seq 解析多聚核糖体翻译过程

核糖体印记测序, 可以对正在翻译的RNA进行检测。Ribosome profiling是针对与核糖体结合,长度约为30nt,正在翻译的RNA片段进
行富集、测序和定量。据此可推测起始密码子位置(包括非AUG起始)以及uORFs等信息。

物种广、瞬时性

作为连接转录和蛋白层面的桥梁,Ribo-seq对瞬时停止翻译延伸过程的样本进行高通量测序分析。解析多聚核糖体在RNA上的翻译印记。在翻译层面
解析生命过程中的差异表达基因,如:环境刺激、代谢或疾病发生,影响翻译效率;RNA结构或转录组后修饰,影响翻译产物。为科研工作展开新的视角

科学方案设计

从材料选取,建库测序,到数据分析,
每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。

信息分析

诺禾致源Ribo-seq测序项目,通过对核糖体包裹的RNA小片段进行建库测序,获得高质量reads。分析流程分为两个模块。首先是标准
分析流程,该部分的分析与mRNA-seq数据进行关联,主要分析的是样本的翻译效率及翻译全局景观的分析。另一部分是个性化分析,
该部分为Ribo-seq与ncRNA-seq及蛋白质组数据的关联分析,主要内容为新可翻译分子的鉴定、蛋白质组差异表达关联分析

项目经验

人、大小鼠、鸡、山羊、猪、海产动物等细胞和组织样本;拟南芥、杨树、烟草、番茄、菊花、玉米、大豆、水稻、棉花等组织和RPF样本; 疟原虫、昆虫等。

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