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基因分型

多重PCR_SNP检测

多重PCR_SNP基因分型检测——高通量的SNP检测技术

  • 多重PCR_SNP基因分型检测是一种多重PCR和高通量测序相结合的高效SNP检测技术。通过对多个待检位点设计特异性引物,利用多重PCR技术进行扩增, 即可一次性扩增出所有待检位点序列,继而结合高通量测序技术实现对大样本多位点SNP的检测。
  • 适用性广:

    该技术适用于所有有参物种的SNP检测。
  • 准确性高、效率高:

    多重PCR_SNP基因分型检测结合高通量测序技术对样本进行深度测序,可以高效的完成基因分型检测,一次可以完成3000个样本检测, 检出率大于95%。
  • 成本低:

    对于大样本、多位点SNP的检测,多重PCR_SNP基因分型检测的成本要远远低于Sanger检测。

应用方向

  • 疾病基因组研究

    人群队列研究
  • 癌症基因组研究

    感兴趣SNP位点的验证、信息挖掘
  • 临床分子诊断研究

    WGS/WES等需要后期SNP验证、信息挖掘

诺禾优势

  • 1.专业背景强

    基于成熟的生物信息分析人才,专业的项目分析,可以根据客户不同要求分析个性化内容
  • 2.科学方案设计

    从材料选取,建库测序,到数据分析,每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。

    特异性引物设计

    DNA提取>0.6 ug

    多重PCR扩增

    文库构建180-220 bp

    PE150测序
    位点平均检出率95%

    信息分析

信息分析

产品 分析内容
多重 PCR_SNP 1. 原始数据整理统计
2. 扩增子测序深度统计
3. SNP、Indel 检测
4. HWE 统计

动植物多组学

疾病多组学

癌症多组学

微生物多组学

转录调控和蛋白多组成

表观遗传(染色质微环境)

送样建议

样本类型 送样建议
动物组织样本 >0.5g(不同组织类型需根据实际得率而定)
核酸DNA >40ng/μl,50个位点以内体积大于20μl;
每增加50个位点,DNA体积增加10μl
细胞 ≥ 5×10 6
全血 ≥ 1.5mL

常见问题

  • 1.多重PCR_SNP基因分型检测与Sanger测序的比较分析?

    • Sanger测序可以完成对SNP的检测,但是对于样本量大位点多的SNP检测项目,Sanger测序需要运行多次程序进 行序列的测定,成本高且效率低; 多重PCR_SNP基因分型检测应用多重PCR可一次完美扩增出所有待检SNP位 点,通过高通量测序技术高效获得所有SNP碱基类型,单个SNP的检测成本远远低于Sanger测序。
  • 2.多重PCR_SNP基因分型检测与KASP的优势比较 ?

    • KASP优势:灵活性高。无论样本、位点的多少,均可以运用KASP进行SNP分型检测。 多重PCR_SNP基因分型检测优势:通量高。适合样本量大、SNP位点多的检测项目,可一次性进行3000样本的检 测; 前期不需要提供候选基因型。
  • 3.客户送样时可以提供什么样品呢?

    • 客户提供任何有参物种的DNA样本均可以检测,另外可以接收血液、细胞等。
  • 4.多重PCR_SNP基因分型检测需要提供参考序列吗?

    • 需提供待检SNP位点上下游各200 bp的基因序列,以及待检SNP所在参考基因组的位置(ID号),以便公司设计特 异性引物进行目标区域的扩增检测,以及后期提供SNP分型结果。

拓展材料

  • 收藏好文

    “多重PCR”与“高通量”的完美碰撞

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