UMI转录组测序

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实现更准确定量

RNA-seq 文库构建过程中,cDNA PCR 扩增时的片段扩增速率并不相同,因 PCR 扩增产生的扩增重复导致后续分析中各个基因表达量和真实情况不一致,降低了结果的可信度。在一些起始样本量小的测序中会显得更为突出。UMI 转录组在文库扩增前为每一条逆转录的 cDNA 添加唯一的分子标签,标签伴随着片段扩增、测序和分析的全部过程,利用 UMI 追溯每一个片段的来源,准确去除 PCR 扩增重复,一比一准确还原样本扩增前的原始状态。

解析基因密码

UMI 转录组采用 Illumina 测序平台,适用于真核生物有参和无参物种。对组织或细胞在某个特定状态下转录的所有 mRNA 进行测序,使用 UMI-tools 提取 clean reads 中具有UMI 标签的序列的 reads,全面快速分析 mRNA 序列和丰度信息,统计可变剪切和预测新转录本。

项目经验

可接样本类型:动物组织,植物组织,全血,细胞,菌类等真核生物样本,包含有参和无参物种。

诺禾致源已经成功对水稻、玉米、油菜、梭梭、蜜蜂、黄姑鱼、疟原虫、人、大鼠等上百个有 / 无参考基因组的物种进行了 UMI 转录组测序分析。

项目周期

测序类型 周期 测序平台 推荐数据量
UMI转录组 35天 Novaseq 6G

科学方案设计

从样本提取,建库测序,到数据分析,
每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。

信息分析

诺禾致源 UMI 转录组测序项目信息分析,经过严格数据质控保证数据分析可靠性,信息分
析分为表达水平分析和结构水平分析。

基因结构水平分析 基因表达水平分析
与参考基因组比对 基因表达水平分析
新转录本预测 差异基因分析
可变剪切分析 GO/KEGG富集分析
SNP分析 蛋白互作网络分析
InDel分析 转录因子分析

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