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Robust elimination of genome-damaged cells safeguards against brain somatic aneuploidy following Knl1 deletion

期刊:Nature Communications
影响因子:16.6
发表单位:密歇根大学
发表时间:2019 年

一、研究背景

细胞分裂过程中,需要维持基因组的稳定性。染色质分离和 DNA 合成过程通常伴随着体细胞基因突变,细胞通过 DNA 修复、细胞周期检测点等机制降低基因组受损的可能性。人类大脑组织中未被监测清除的体细胞突变很有可能诱导一系列疾病和大脑功能异常。因此,脑区的体细胞突变的发生机制、突变的后续影响都需要进一步的研究。

二、研究结果

作者选取对照组和 KNL1 敲除的脑皮层样本进行 UMI 转录组测序,差异基因表达分析鉴定出 47 个差异表达基因(FDR<0.05)。突变体中 19 个差异基因表达上调,其中 8 个基因有研究表明受 p53 因子激活表达,或者基因位置是 p53 的结合位点。ddRT-PCR 检测了三个上调基因(Ano3,Eda2r,Pvt1)的表达量,结果与 UMI 转录组的基因上调表达趋势一致。 placeholder+image 图1 Knl1 cKO脑中p53及其靶基因的DNA损伤与激活

参考文献

Shi L , Qalieh A , Lam M M , et al. Robust elimination of genome-damaged cells safeguards against brain somatic aneuploidy following Knl1 deletion[J]. Nature Communications, 2019, 10(1):2588.

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