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Bionano建库测序—捕获物理图谱数据,还原单分子结构
Bionano 基于 Nanochannel array 技术可以高通量地对通过 Nanochannel 的被荧光标记的 DNA 分子自动拍照成像,完整的还原单分子结构。该技术不需要将 DNA 分子打断成短片段,也不进行扩增,因而具有较长的读长,最长读长可达 Mb 级别,其能够真实地展示基因组信息。该技术对于获取高复杂区域重复序列信息、检测基因组结构变异有着无与伦比的优势,是当前基因组研究的有力武器。应用方向
Saphyr 系统以100kbp-Mbp级别读长可实现超高灵敏度的结构变异检测分析和复杂基因组de novo组装。在结构变异检测领域目前广泛应用于肿瘤、白血病、遗传病、罕见病等疾病的研究。诺禾优势
1.高通量
诺禾致源拥有最新的Saphyr DC平台及Saphyr chip,单张芯片最高可产出3.9T的数据。2.周期短
得益于新平台及芯片的高通量,平均每12h可以完成3个人类样本的检测(100×),带给您卓越的周期体验。3.更超长
崭新的DLS标记技术无需对双链DNA进行切割标记,避免了任何可能的物理损伤,竭尽全力保证分子长度,发挥平台优势。信息分析
涉及产品 | 分析内容 | 解决问题 |
---|---|---|
建库测序 | 测序数据质量评估 | 过滤掉低质量数据,保证数据质量 |
Bionano辅助组装 | 测序数据质量评估 | 过滤掉低质量数据,保证数据质量 |
辅助挂载 | 提高scaffold,提升组装质量和完整性 | |
Bionano变异检测 | 测序数据质量评估 | 过滤掉低质量数据,保证数据质量 |
变异检测 | 寻找平衡易位和倒位 | |
变异位点注释 | 仅针对人类样本 |
送样建议
样本类型 | 样本总量(单次建库) | 备注 |
---|---|---|
血液 | 650ul-1ml全血 | Bionano提取需要1.5*106个白细胞作为提取的起始量。 |
细胞 | 1.5x10^6个细胞 | 细胞培养物冷冻前 |
动物组织 | 30-50mg | 按10mg为单位分装 |
植物组织 | 0.5g | 优先提供萌发幼苗 |
常见问题
1. Bionano 对样本要求有哪些?
2. 如何评估 Bionano 数据质量?
3. Bionano 中 NRLS 与 DLS 区别有哪些?
DLS 标记方法
DLS 标记方法
4. Bionano 是否可以混样?
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