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外泌体非编码RNA测序—挖掘细胞间通讯信息交流分子
外泌体非编码RNA测序:
富集血清、血浆、细胞上清等体液中或者组织培养的外泌体,通过非编码RNA测序筛选差异信号分子,研究潜在biomarker, 预测分子潜在功能,挖掘通路分子间相互作用模式,揭示生命活动胞间信号通讯机制,探索复杂生命活动形态。多种富集方式:
提供试剂盒(PEG沉淀法)、超速离心、SEC(凝胶排阻色谱法)和密度梯度离心法,针对不同样本来源、不同分离需求和不同研究目的的外囊泡进行针对性的富集。全套鉴定方法:
电镜鉴定用于鉴定外泌体囊泡结构,粒径检测用于测量外泌体浓度与直径大小;western-blot/纳米流式用于检测表面标志性蛋白以确定富集样本为外泌体。应用方向
肿瘤发生、生长、侵袭与转移诺禾优势
1. 富集鉴定手段多样
2. 质控严格,分析流程全面
诺禾致源外泌体lncRNA低起始量去核糖体微量建库深度挖掘未知分子;YRNA、tRNA等多类型外泌体smallRNA注释从多角度解析功能机制;疾病、癌症注释等个性化分析升华研究新高度, 打造不同分子间的互作关系网...3. 项目文章以及物种经验丰富
诺禾致源已经成功完成对血清、血浆、细胞上清、脑脊液、尿液、牛奶、乳汁、精浆、卵泡液、癌组织、富集好的外泌体等多种类型的外泌体非编码RNA测序项目,涉及物种包括人、大小鼠 、牛、鸡、生姜等多个物种,助力客户在Theranostics、JEV等权威杂志发表多篇高水平文章。信息分析
诺禾致源外泌体非编码RNA测序,针对外泌体中的smallRNA、lncRNA、circRNA以及mRNA进行分析,挖掘调控网络。此外,诺禾致源提供个性化分析的服务,可以根据客户需求定制分析内容。标准分析 | 高级分析与绘图 |
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lncRNA smallRNA circRNA 全转录组关联分析 ceRNA 分析 |
WGCNA 转录因子分析 GSEA 分析 STEM 分析 iPath 分析 免疫相关因子分析 个性化 circos 图绘制 高级热图绘制 富集圈图 |
其他分析小工具可参考云平台 NovoMagic |
关联分析
通过外泌体RNA测序与蛋白组学进行关联分析,可以挖掘潜在的新型编码蛋白,或在表达量层面将基因与蛋白相关联,剖析作用机制或功能特征。详见转录调控与蛋白多组学。送样建议
样本类型 | 送样建议 |
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血清/血浆 | ≥4 ml |
细胞上清 | ≥30 ml |
脑脊液 | ≥10ml |
常见问题
1.外泌体鉴定粒径浓度够,但是WB检测无条带的原因是什么?
2. 送血浆(plasma)还是血清 (serum)?
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