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转录调控测序

外泌体非编码RNA测序

外泌体非编码RNA测序—挖掘细胞间通讯信息交流分子

  • 外泌体非编码RNA测序:

    富集血清、血浆、细胞上清等体液中或者组织培养的外泌体,通过非编码RNA测序筛选差异信号分子,研究潜在biomarker, 预测分子潜在功能,挖掘通路分子间相互作用模式,揭示生命活动胞间信号通讯机制,探索复杂生命活动形态。
  • 多种富集方式:

    提供试剂盒(PEG沉淀法)、超速离心、SEC(凝胶排阻色谱法)和密度梯度离心法,针对不同样本来源、不同分离需求和不同研究目的的外囊泡进行针对性的富集。
  • 全套鉴定方法:

    电镜鉴定用于鉴定外泌体囊泡结构,粒径检测用于测量外泌体浓度与直径大小;western-blot/纳米流式用于检测表面标志性蛋白以确定富集样本为外泌体。

应用方向

肿瘤发生、生长、侵袭与转移
免疫应答、细胞凋亡、血管生成、炎症反应
细胞间信号传递与交流媒介
靶向药物载体

诺禾优势

  • 1. 富集鉴定手段多样

  • 2. 质控严格,分析流程全面

    诺禾致源外泌体lncRNA低起始量去核糖体微量建库深度挖掘未知分子;YRNA、tRNA等多类型外泌体smallRNA注释从多角度解析功能机制;疾病、癌症注释等个性化分析升华研究新高度, 打造不同分子间的互作关系网...
    从材料选取,样本富集提取、建库测序,到数据分析,每一步都经过科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。
  • 3. 项目文章以及物种经验丰富

    诺禾致源已经成功完成对血清、血浆、细胞上清、脑脊液、尿液、牛奶、乳汁、精浆、卵泡液、癌组织、富集好的外泌体等多种类型的外泌体非编码RNA测序项目,涉及物种包括人、大小鼠 、牛、鸡、生姜等多个物种,助力客户在Theranostics、JEV等权威杂志发表多篇高水平文章。
    “科学的方案设计,严格的质控管理,专业的分析团队,丰富的项目经验,优质的项目服务”,确保每一个环节都能出色完成,助力科学研究。

信息分析

诺禾致源外泌体非编码RNA测序,针对外泌体中的smallRNA、lncRNA、circRNA以及mRNA进行分析,挖掘调控网络。此外,诺禾致源提供个性化分析的服务,可以根据客户需求定制分析内容。
标准分析 高级分析与绘图
lncRNA
smallRNA
circRNA
全转录组关联分析
ceRNA 分析
WGCNA
转录因子分析
GSEA 分析
STEM 分析
iPath 分析
免疫相关因子分析
个性化 circos 图绘制
高级热图绘制
富集圈图
其他分析小工具可参考云平台 NovoMagic

关联分析

通过外泌体RNA测序与蛋白组学进行关联分析,可以挖掘潜在的新型编码蛋白,或在表达量层面将基因与蛋白相关联,剖析作用机制或功能特征。详见转录调控与蛋白多组学。

送样建议

样本类型 送样建议
血清/血浆 >4 ml
细胞上清 >30 ml
脑脊液 >10ml

常见问题

  • 1.外泌体鉴定粒径浓度够,但是WB检测无条带的原因是什么?

    • 因为外泌体存在免疫分型,可能是某样本中表达本来就低,导致检测不到,就是WB有些指标是检测不到的;不是某一个项目的问题,而是由于外泌体本身的特性。没有什么普适的, 尤其是细胞上清没有规律,血浆率低的话,可能WB极限就检测不到了。一般推荐2-3个阳性,1个阴性。阳性率低的原因是跟样本本身有关。
  • 2. 送血浆(plasma)还是血清 (serum)?

    • 推荐使用血浆,因为血清收集后在凝血过程中,血小板受到刺激会产生许多外泌体和其他形式的小泡,因此血清中获得的小泡始终比血浆中多,甚至超过50%的小泡来源于血小板。 所以血浆是研究病理生理状态下外泌体更好的介质。多数的criculating Exosome研究样本使用的是血浆。
      诺禾致源拥有专业的设计方案、严格的质控管理,专业的分析团队,丰富的项目经验,优质的项目服务,确保每一个环节都能出色完成,助力您的科学研究。

拓展材料

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