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诺禾致源

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基因组测序

泛基因组测序—探秘物种间潜在密码

泛基因组包括核心基因组(Core genome)和非必须基因组(Dispensable genome)。其中,核心基因组由所有样本中都存在的序列组成,一般与物种生物学功能和主要表型特征相关,反映了物种的稳定性; 非必须基因组由仅在单个样本或部分样本中存在的序列组成,一般与物种对特定环境的适应性或特有的生物学特征相关,反映了物种的特性。针对不同但又相互关联的个体材料进行较高深度测序,单独进行 组装,构建泛基因组图谱,以期获得该物种完整的遗传信息。

应用方向

  • 物种起源及演化
    重要性状相关基因资源及科学育种
    适应性进化
    外来物种入侵性

诺禾优势

  • 1.顶级研究实力

    自2014年诺禾致源在Nat Biotechnol上发表大豆泛基因组研究成果以来,诺禾致源的基因组合作项目遍布全球,引领基因组研究潮流。泛基因组研究覆盖样本更为广泛、研究更为全面和彻底,并具有各自的数据挖掘亮点,为大范围的物种进化和育种研究提供了坚实有力的支撑,具有重要意义。
    • 50人

      分析团队
    • 7年

      项目经验
    • 1000+

      结题项目
    • 1对1

      项目服务
  • 2.科学方案设计

    从材料选取,建库测序,到数据分析,科学、缜密的设计保障高质量研究成果。
    物种基因组特点 简单基因组 复杂基因组 超复杂基因组
    低指标组装 高指标组装 低指标组装 高指标组装 低指标组装 高指标组装
    测序策略 50×PacBio/Nanopore
    +100×Illumina
    80×PacBio/Nanopore
    +100×Illumina
    50×PacBio/Nanopore
    +100×Illumina
    100×PacBio/Nanopore
    +100×Illumina
    50×PacBio/Nanopore
    +100×Illumina
    100×PacBio/Nanopore
    +100×Illumina
    组装指标 哺乳动物&鸟:
    contigN50>1 Mb;
    其他简单基因组:
    contigN50>500 Kb
    哺乳动物&鸟:
    contigN50>3 Mb;
    其他简单基因组:
    contigN50>2 Mb
    哺乳动物&鸟:
    contigN50>300 Kb;
    其他简单基因组:
    contigN50>100 Kb
    哺乳动物&鸟:
    contigN50>2 Mb;
    其他简单基因组:
    contigN50>500 Kb
    contigN50>100 Kb contigN50>100 Kb
  • 3. 全面信息分析

    综合变异检测、泛基因组特征分析、比较基因组分析、SV分析、图基因组构建与关键变异展示,锁定研究潮流,呈现全面结果。

信息分析

拓展材料

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