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基因分型

ASA全基因组芯片

ASA-750K芯片——更适合中国人队列研究

  • ASA(Asian Screening Array)芯片是 Illumina 一款基于9000+东亚人全基因组测序数据设计的全基因组 SNP 芯片, 该芯片包含70万个标记,是对东亚地区的低频突变体(MAF 为 1%~5%)覆盖度较好的芯片;诺禾在此基础上新增了5万个特有的标记。

位点信息

  • 基因组骨架(550K):9000+亚洲人15~30× 全基因组测序数据;疾病/性状相关位点。
    临床研究位点(100K):常见疾病、HLA、药物基因组相关等。
    探索性研究(50K):非临床相关基因的外显子区域。
    样本指控(10K):血型判断、性别。
    定制位点(50K):疾病相关位点;性染色体位点。

应用方向

  • 队列研究

    疾病与风险因素、遗传特征等研究
  • 癌症疾病

    肿瘤、免疫病、肥胖、代谢疾病等研究。寻找差异SNP位点。
  • 药物基因组学研究

    研究基因变异所致的不同疾病对药物的不同反应

诺禾优势

  • 1.专业背景强

    基于成熟的生物信息分析人才,进行专业的项目分析。
  • 2.科学方案设计

    从材料选取、探针捕获、到检测分析,每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。

    DNA样本准备

    DNA片段化

    iScan检测

    数据分析

信息分析

诺禾致源WGBS基于全基因组水平,实现单碱基分辨率的甲基化位点精准定位,快速准确找到差异位点,实现高效分析DMR及相关基因的功能分析。
产品 分析内容
ASA 全基因组芯片 1.样本各位点分型结果
2.样本检出率、性别判断

送样建议

样本类型 送样建议
组织样本 ≧3g;≧1g(样品珍贵);口腔拭子≧3份
核酸DNA 不少于30ng/μl,不少于30μl
细胞 ≥ 5×10 6
全血 ≥ 1.5mL

常见问题

  • 1. ASA 全基因组芯片比较适合哪些研究项目?

    (1)疾病研究:利用 ASA 全基因组芯片进行 GWAS 研究,从基因层面解析复杂疾病。
    (2)药物基因组学研究:研究基因变异所致的不同疾病对药物的不同反应。
    (3)临床科学研究:筛查遗传病、肿瘤、罕见病等。
    (4)追溯祖源:查找祖源信息并利用祖源区分易感基因、研究遗传性疾病等。
  • 2. ASA 芯片与同类型芯片相比,其优势是什么?

    芯片 ASA GSA Zhonghua-8
    检测位点数 750K 660K 880K
    样本/芯片 24 24 8
    测序平台 iScan iScan iScan
    通量 4608样本/周 4608样本/周 4608样本/周
    低频覆盖度 24% (MAF 1~5%) MAF>1% 65% (MAF>1%)
    适用人群 东亚人 全球人 中国人
  • 3. ASA全基因组芯片送样量和周期

    送样量:DNA浓度>30 ng/μL,体积>30 μL。
    周期:15个自然日/1000个样本。

拓展材料

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