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基因组测序

三代建库测序服务

三代建库测序—单分子实时测序,数据极致便捷。

第三代测序技术是指单分子实时测序技术,也叫从头测序技术。与前两代测序技术相比,其最大的特点就是单分子测序,测序过程无需进行PCR扩增,实现了对每一条DNA/RNA分子的单独测序。
诺禾致源为客户提供的三代建库和测序服务,均使用官方指定、主流期刊认可的建库和PacBio 或 Nanopore 原装试剂盒。

应用方向

  • 在动植物,微生物,医学等多个领域,在基因组测序、转录组测序、甲基化研究和突变鉴定等方向得到广泛的应用,解决了众多以往无法解决的科学难题,将科学研究引领到一个前所未有的新高度。

诺禾优势

  • 1. 多样化建库类型

    诺禾致源拥有DNA文库和RNA文库,DNA文库又分为PacBio文库和Nanopore文库。 测序平台可以提供PacBio sequel II 、PacBio sequel IIe和 Nanopore PromethION 48 三种选择,可为客户提供多种测序读长和数据量选择。
  • 2.物种经验丰富

    从PacBio sequel平台引进起,三代平台实验团队已积累5年测序经验。
  • 3.专业的生产团队和高效的运营团队

    保证客户项目周期和数据质量,为客户提供快速简单的测序服务。
    • 19D+

      建库测序
    • Clean data

      数据类型

送样建议

文库类型 样本总量(单次建库) 样本浓度(Qubit) 长度要求
PacBio ccs文库 ≥10 μg ≥80 ng/μL 片段大小在30Kb以上
PacBio clr文库 ≥10μg ≥80 ng/μL 片段大小在30Kb以上
Nanopore Ultr-long文库 ≥45 μg ≥55 ng/μL 片段大小在50Kb以上
Nanopore 普通文库 ≥10 μg ≥100 ng/μL 片段大小在30Kb以上
RNA文库 ≥5μg ≥300ng/μL RIN≥8
更多送样建议

常见问题

  • 1. 三代测序准确率如何?

    • 三代测序的碱基错误率是随机产生的,通过增加测序深度,能够迅速提升准确性(一般覆盖到10X以上,正确率可以达到99.9%);无测序偏好性:可以最大程度上还原基因实际情况; 三代DNA reads平均读长大于10kb,具体产出情况与文库构建相关,可以比较均匀的覆盖参考基因组,明确比对到相应区域,避免假阳性的同时,得到更加准确的变异位点和类型。
  • 2. PacBio 平台的产出情况如何?

    • 目前的 PacBio Sequel Ⅱ 平台 CLR 模式单张芯片产出在100-150 G 之间,CCS 模式产出大概在250-300 G 之间,具 体的产出与文库质量、文库大小相关。一般de novo项目文库类型为CLR-20K、CLR40K、CCS-15K,CLR模式平均读长在10-20K,subreads N50长度在20-30K之间。CCS模式 平均读长在10-15K,subreads N50长度在10-15K之间。
  • 3. CLR 和 CCS 的区别在哪?

    • CLR的插入片段长,对文库的测序 <2 passes (从接头读到接头),这样的 reads 测序错误率等同于原始的测序错误率,主要用于基因组 de novo 时的大片段文库测序,一般插入片段大小  >15K;CCS的插入片段短,对文库的测序 ≥ 2 passes,将相同的 subreads 整合后产生的 CCS reads 准确率会有显著的提升,可用于全长转录组、全长16s、变异检测等较小片段文库测序 ,一般插入片段大小在 10K 左右。
  • 4. Nanopore 平台的产出情况如何?

    • 目前 PromethION 平台单张芯片普通DNA文库产出能稳定在 60G,最高可到 100G 以上。一般 de novo 项目文库下机数据的平均读长在 15-20K,read length N50 在 30-40K。对于 Ultra-long  reads 文库,其平均读长可达到30-40K,read length N50 更能达到 60K 以上,产出大概在 40G 左右。

拓展材料

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