基因组测序>
建库测序>
人类基因组测序>
动植物基因组测序>
微生物基因组测序>
转录调控测序>
表观组测序>
单细胞测序>
空间转录组>
基因分型>
质谱分析>
蛋白组学分析>
代谢组学分析>
免疫定量>
多组学联合分析>
分子育种>
动植物基因组测序>
全转录组测序—研究非编码RNA与mRNA间的靶向调控以及相互作用关系
全转录组高通量测序,采用去核糖体链特异性建库方法和小片段富集筛选建库方法,可实现编码RNA和非编码RNA的建库、测序、信息分析及联合分析、ceRNA等,从而快速全面准确地获得与特定生物学过程 (例如发育、疾病等)所有RNA转录本数据信息,通过数据分析将生物调控机制研究延伸到“ 网、多层面”结合的立体模式,有助于相对全面解读生物学现象。1.两库全转录组测序:LncRNA+Small RNA
(1)采用去核糖体链特异性建库模式,进行PE150测序,实现lncRNA、mRNA、circRNA鉴定和定量、以及功能分析;2.三库全转录组测序:LncRNA+ Small RNA+ CircRNA
(1)采用去核糖体链特异性建库模式,进行PE150测序,实现lncRNA、mRNA、鉴定和定量、以及功能分析;应用方向
动物方向
人、小鼠、斑马鱼等胚胎发育、性腺发育、肌肉发育和免疫调控生命过程研究。植物方向
植物逆境响应、器官发育、生殖生长和病毒侵染等研究。癌症疾病方向
肿瘤、精神疾病、代谢病、心血管病、免疫病等疾病发生与诊治研究。诺禾优势
1. 周期快、质量好,稳定性高
诺禾全转录组测序采用先进的Illumina平台测序,并与高性能计算平台(High Performance Computing,HPC)结合,实现快速、稳定的测序数据分析及交付。交付周期<60天
测序平台Novaseq
2. 方案设计专业,质控严格
诺禾全转录组测序采用去核糖体链特异性建库方式和小片段富集筛选建库方法,能够满足同时对lncRNA、circRNA、smallRNA和mRNA的差异表达水平分析、功能预测及关联分析。从材料选取,建库测序,到数据分析,每一步都经过科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。材料选取
提取RNA
≥ 3.0μg
文库构建
PE150测序
SE50测序
信息分析
3. 项目文章以及物种经验丰富
诺禾致源已成功完成对人、小鼠、鸡、牛、猪、斑马鱼、水稻、等近百个物种的全转录组分析,助力客户科学研究及文章发表。“科学的方案设计,严格的质控管理,专业的分析团队,丰富的项目经验, 完善的项目服务”,确保每一个环节都能出色完成,助力科学研究。80人
分析团队10年
项目经验2000+
结题项目1对1
项目服务信息分析
诺禾致源全转录组测序项目,既有lncRNA、circRNA、miRNA和mRNA的标准分析,又有全转录组关联分析。全转录组关联分析分为WTS和ceRNA两种分析流程。关联分析
1.LncRNA与mRNA关联分析
2.lncRNA与miRNA关联分析
3.miRNA与mRNA关联分析
4.lncRNA、miRNA与mRNA关联分析
5.circRNA与miRNA关联分析
6.circRNA、miRNA与mRNA关联分析
送样建议
样品类型 | 送样建议 | 备注 |
---|---|---|
新鲜动物组织 | 900mg | 脂肪等 RNA 得率低的组织 2 g 以上 |
新鲜植物组织 | 1500mg | 含水量大的组织 2 g 以上 |
新鲜培养细胞 | 2*10^7 | 去除培养基 |
新采集的全血 | 6ml | 血液样本送样签加入EDTA抗凝管,推荐使用BD管送样 |
Total RNA建库起始量 | ≥3ug或≥5ug | 两库全转:≥3ug; 三库全转:≥5ug |
常见问题
1.全转录组产品两种技术模式如何选择?
2.lncRNA建库测序结果可以用于分析环状RNA吗?
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