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基因组测序

16S/18S/ITS等扩增子测序(三代)

16S/18S/ITS等扩增子测序(三代)
一次分析多个高变区信息,还原真实微生物群落结构

全长扩增子(16S/18S/ITS)测序基于Pacbio长读长测序平台,以16S为例,可以一次性获得9个高变区序列信息,获得注释到“种”的分类鉴定!不仅可以提高物种鉴定分辨率,还可以通过全长序列进行准确的物种注释,从而更加真实地还原样本中微生物的群落结构。

应用方向

细菌多样性研究:16S全长
真菌多样性研究:ITS全长
真核微生物多样性研究:18S全长
功能基因研究:反硝化细菌nirS、固氮菌nifH等

诺禾优势

  • 1. 一次性获得全部变异区序列信息,种级别物种注释率高

    不同来源样本二代与三代扩增子注释到种级别的占比
    样本类型 二代种水平比例 三代种水平比例
    土壤 10%-20% 60%-70%
    人粪便 20%-30% 60%-70%
    口腔拭子 15%-20% 60%-70%
    动物粪便 10%-20% 60%-70%
  • 2. 周期短,质量好

    基于Pacbio长度长测序平台,并与高性能计算平台(High Performance Computing,HPC)结合,实现快速、稳定的测序数据分析及交付。全长扩增子建库-测序-分析,仅需30天
    • 20,280个

      物理核数
    • 1,727 T flops

      计算峰值速度
    • 400 TB

      总内存
    • 58.6PB

      总储存
  • 3. 分析流程严格,方案设计专业

    诺禾致源全长扩增子具有更为严格的分析流程,从质控到分析,“步步为营”,“精心布阵”,为您的paper保驾护航!
    • 60人

      分析团队
    • 7年

      项目经验
    • 5000+

      结题项目
    • 1对1

      项目服务

信息分析

诺禾致源基于测序得到的序列,进行 OTU 聚类和物种注释分析,获得物种的丰度分布,从而全面分析样本内物种的丰富度及组间差异。
标准分析 解决问题
物种注释 物种注释及各物种丰度信息
α- 多样性分析 微生物群落的丰富度和多样性
β- 多样性分析 不同样本间的微生物群落及各样本差异情况
多元统计分析 寻找组间具有显著差异的物种,同时可以比较组内差异和组间差异的大小,判断分组
是否有意义。
CCA 分析 研究物种组成与环境因子的关系
环境因子关联分析
VPA 分析

送样建议

样本类型 建议送样量 最低送样量
土壤/污泥/沉积物/腐殖质 3-5g 1g
水体滤膜
(孔径 0.22-0.45μm/直径 3-4cm)
2-3 张 1张
拭子 3-5 个 1 个
瘤胃液/发酵液/组织液
(离心有明显沉淀)
3-5mL 1mL
粪便/肠道内容物 3-5g 1g
动物/人组织 1-3g 1g
血浆 3-5mL 1mL

常见问题

  • 1. 三代扩增子有什么优势?

      三代扩增子可以获得更准确的物种注释结果,一次实现多个高变区的扩增和测序,种水平注释结果可信度更高。

  • 2. 样本送到公司,什么时候可以拿到结果?

      三代扩增子可以获得更准确的物种注释结果,一次实现多个高变区的扩增和测序,种水平注释结果可信度更高。自样本检测合格之后开始计算周期,包括建库、测序、数据分析、结题。全长扩增子周期共计30个自然日。

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