基因组测序>
建库测序>
人类基因组测序>
动植物基因组测序>
微生物基因组测序>
转录调控测序>
表观组测序>
单细胞测序>
空间转录组>
基因分型>
质谱分析>
蛋白组学分析>
代谢组学分析>
免疫定量>
多组学联合分析>
分子育种>
动植物基因组测序>
WGS全基因组脱靶检测——基于CAS9的脱靶检测高级分析
WGS全基因组脱靶检测:
对具有参考序列(Reference Sequence)的不同个体, 采用WGS方法进行全基因组测序,利用生物信息学,对全基因组范围内发生的SNPs和InDels进行准确分析。检测全面、精准分析:
全基因组范围内进行广泛扫描,准确检测编辑信息。应用方向
筛选脱靶位点
CRISPR/Cas9 技术对细胞系进行编辑后,药物筛选所得表型但是靶点未发生编辑,寻找脱靶位点;筛选全基因组内是否存在其他脱靶位点。寻找插入位置
在基因组中随机插入一段序列,需要明确插入位置的研究。如:CRISPR/Cas9 敲入技术或转基因插入研究。队列研究
疾病与风险因素、遗传特征等研究。癌症疾病
肿瘤、免疫病等研究。探究肿瘤进化机制、寻找肿瘤治疗靶标、高效探索药物机制、开发联合用药等。动植物研究
性状筛选。诺禾优势
1.专业背景强
基于成熟的生物信息分析人才,专业的项目分析,可以根据客户不同要求分析个性化内容,在全基因组范围内对编辑位点和脱靶位点,进行准确的定位分析,并且针对于感兴趣片段进行准确定位。2.物种经验丰富
诺禾致源不仅对人,大鼠,小鼠等物种进行全基因组脱靶检测分析,还在烟草、大豆、油菜、食蟹猴等物种中有项目经验! 助力客户发表更高水平的文章。3.科学方案设计
从建库测序,到数据分析,每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。
DNA
(0.6μg)
文库构建
(DNA小片段文库)
测序
(PE150)
生物信息分析
信息分析
产品 | 分析内容 |
---|---|
基因敲除 |
1. 数据质控 2. 测序深度、覆盖度统计 3. SNP/Indel 检测、注释及统计 4. 特有 SNP/Indel 检测 5. sgRNA 同源区域筛选 |
基因插入 |
1. 数据质控 2. 测序深度、覆盖度统计 3. SNP/Indel 检测、注释及统计 4. 将插入序列 mapping 到参考基因组中,确定基因插入到染色体上的位置 |
送样建议
样本类型 | 送样建议 |
---|---|
动物组织样本 | ≥ 0.5g |
植物组织样本 | ≥ 0.5g |
核酸DNA | 浓度>60ng/μl,体积大于10μl |
细胞 | ≥ 5×10 6 |
全血 | ≥ 1.5mL |
常见问题
1.全基因组敲除脱靶检测对于物种是否有限制?
2.基因敲除脱靶检测同源区域是根据什么进行筛选的?
3.插入分析与敲除分析的区别?
4.是否能对插入基因进行拼接?
5.基因插入的全基因组检测,是否需要提供 control 组样本?
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