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基因分型

质谱SNP检测——高精度SNP分型技术

  • 质谱SNP分型技术即是将PCR技术与质谱相结合,利用质谱分析对质量灵敏度高的特点,对待检SNP实现高精度分型。MassARRAY质谱系统在SNP分型市场上占有重要地位, 飞行时间质谱平台(MALDI-TOF)作为国际通用的基因单核苷酸多态性(SNP)的研究平台,对于SNP分型具有重要应用价值。
  • 周期短:

    运用384板,高效快速完成检测。
  • 成本低:

    对于大样本、多位点SNP 的检测,质谱检测成本要远远低于Sanger检测。
  • 准确率高:

    MALDI-TOF平台检出率可达95%,准确率98%以上。

应用方向

  • 人群队列研究

    对特定位点进行SNP基因分型检测,探索待检位点与疾病的关系
  • 疾病基因组

    WGS重测序之后,对感兴趣的SNP位点进行后续的大量验证,探索与疾病的相关性
  • QTL定位

    WES全外显子测序之后,需要对候选的SNP位点进行大量验证,寻找分子标记

诺禾优势

  • 1.专业背景强

    基于成熟的生物信息分析人才,专业的项目分析,可以根据客户不同要求分析个性化内容
  • 2.科学方案设计

    从材料选取,建库测序,到数据分析,每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。

    高灵敏度多重PCR

    高通量芯片上机

    高精确度质谱分析

    自动化报告生成

信息分析

诺禾致源WGBS基于全基因组水平,实现单碱基分辨率的甲基化位点精准定位,快速准确找到差异位点,实现高效分析DMR及相关基因的功能分析。
产品 基本分析内容
质谱 SNP 1.对候选位点进行评估
2.对待检位点进行引物设计、合成
3.SNP基因分型结果
4.基因分型散点图

送样建议

样本类型 送样建议
动物组织样本 >0.5g(不同组织类型需根据实际得率而定)
核酸DNA 26个位点以内浓度>20ng/μl,体积大于20μl;
每增加26个位点,DNA体积增加10μl
细胞 ≥ 5×10 6
全血 ≥ 1.5mL

常见问题

  • 1.Mass ARRAY 系统可以检测 Indel 吗?

    • Mass ARRAY 系统可以检测 Indel 的插入或者缺失情况。
  • 2.客户在送样时可以提供什么样品呢?

    • 客户提供任意DNA样本,另外可以接收动物血液、培养的细胞等。
  • 3.质谱SNP检测需要客户提供参考序列吗?

    • 对于有rs号的SNP请提供rs号,对于没有rs号的请提供SNP位点上下游各300bp序列,并标注候选基因型。
  • 4.质谱SNP检测的可靠性?

    • Mass ARRAY 系统由美国Sequenom公司开发,广泛应用于疾病研究、分子诊断、分子育种等领域,在Nature、 Science、Blood等期刊上均有文章发表。
  • 5.质谱SNP检测的检出率有多少?

    • 对于已验证的SNP通过MALDI-TOF平台进行检测,检出率一般能达到95%以上。

拓展材料

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    诺禾新秀——质谱SNP检测带你“吃鸡”

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