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分子育种

全基因组选择

  • 全基因组选择主要应用于动植物育种领域,通过使用大量分子标记对样本进行早期选择,减少育种成本投入,缩短育种年限。

全基因组选择育种优势

  • 1、全基因组选择相比传统标记辅助选择由于使用更多的性状关联标记,覆盖了更多的微效位点,对于多基因控制性状的预测结果更加准确。
    2、估计出一套育种值预测模型后,对于候选群体不再依赖表型信息。
    3、 可以大幅缩短世代间隔、提高育种进展达20%~50%。
    4、通过降低育种周期,减少场地占用、人工消耗等长时间的经费消耗,从而大幅减低育种成本。

    全基因组选择研究思路

诺禾致源优势

  • 高精准度: 通过gBLUP、贝叶斯、机器学习模型、深度学习模型等多模型联合分析,综合比较评估后进行模型准确性评价,从而大幅增加育种模型准确性。

    诺禾致源全基因组选择多模型准确性评价及结果韦恩图示例图

    极速周期: 使用最优模型分析,从数据下机到结果交付,最快仅需2天,在保证速度的同时也可使用多模型共同分析,极速周期和高准确度全都要。
    功能拓展:除了全基因组选择服务的提供,诺禾致源可根据位点进行液相芯片设计,降低基因分型成本;或是将训练完成的育种模型搭载至智能育种平台,实现自主快速分析。

测序策略

  • WGS策略:适用于训练群体,测序深度推荐10X,超大基因组可适当降低深度。
    低深度重测序策略:推荐样本数量1000以上,推荐测序深度1X及以上,单样本测序数据量不低于1G,可使用高深度测序数据填充。
    液相芯片策略:适用于候选群体,推荐使用目标性状芯片进行测序。

技术路线

拓展材料

  • 线上课程

    基因测序基础知识系列讲座—分子育种产品知识小课堂
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    分子育种|液相芯片专题(一)基因组选择(Genomic Selection,GS)在种猪育种中的应用
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    种业革命:全基因组选择技术如何助力种业振兴

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