基因组测序>
建库测序>
人类基因组测序>
动植物基因组测序>
微生物基因组测序>
转录调控测序>
表观组测序>
单细胞测序>
空间转录组>
基因分型>
质谱分析>
蛋白组学分析>
代谢组学分析>
免疫定量>
转化医学>
转化医学及临床试验服务>
伴随诊断一站式解决方案>
多组学联合分析>
Altered miR-193a-5p expression in children with cow s milk allergy
期刊:Allergy
影响因子:7.36
发表单位:CEINGE-Biotecnologie Avanzate
s.c.ar.l. Naples, Italy
发表时间:2017年8月
一、研究背景
牛奶过敏(CMA)是儿童最常见的食物过敏症之一。目前研究发现,除了DNA甲基化可以参与CMA发病机制,miRNAs也参与了牛奶过敏的调控机制。miRNAs是一类内源性的小RNA,可 以通过降解mRNA或者抑制翻译过程来抑制靶基因的表达。在CMA的研究中miRNA发挥的作用在很大程度上还是未知的。本研究利用高通量测序手段研究了CMA中起关键调节作用的 miRNA及其靶基因,为CMA发病诊断和治疗策略提供了新思路。
二、方法流程
4-18个月的儿童中获得外周血单 个核细胞:10例CMA患者,9例 超过CMA的CMA患者和11例健康 对照者。
提取Total RNA,
构建small RNA文库
利用Illumina进行测序
测序策略:SE50
筛选出可能调节CMA的候选miRNA miRNA-193a-5p表达水平及其功 能研究
三、研究结果
1.筛选出可能调节CMA的候选miRNA
患病组与健康的对照组相比,差异表达的miRNA中有2个发生了上调,14个发生了下调。与健康对照相比,在诱导儿童CMA产生中miR-193a-5p是发生下调最明显的miRNA。通过预测分析确定了4个miR-193a-5p所作用的靶基因,分别为RPL35A,TP73,ZC3H7B和C/EBPα。其中靶基因C/EBPα在CMA患者中发生了最显著的上调。2.miRNA-193a-5p表达水平及其功能研究
为了研究miR-193a-5p是否可以参与调节CMA中的Th2应答,我们评估了这种特定的miRNA抑制来自健康供体的CD4 + T细胞对IL-4产生的影响。用miR193a-5抑制剂转染的外周血CD4+T细胞显示IL-4 mRNA及其蛋白表达的显着上调。四、研究结论
本研究结果表明,miR-193a-5p是IL-4表达的转录后调节因子,可能在IgE介导的CMA中起作用。这个miRNA可能成为儿童时期食物过敏常见形式的一种新的诊断和治疗靶点。
参考文献
D Argenio V, Del M V, Paparo L, et al. Altered miR-193a-5p expression in children with cow s milk allergy[J]. Allergy, 2017.
Copyright@2011-2023 All Rights Reserved 版权所有:北京诺禾致源科技股份有限公司 京ICP备15007085号-1