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转录调控测序

外泌体非编码RNA测序

案例一 miRNA测序:筛选宫颈癌筛查、诊断及监测的biomarker

发表期刊:Molecular Cancer(IF:10.679)
样本类型:血浆来源的外泌体   
样本:
121例正常人、宫颈癌患者及癌前患者的血浆

分组:
(1)CIN I-:健康人和CIN I 患者(对照)
(2)CIN II+ :CIN II-III、CC(ACC和SCC)
分组策略可增加每组样本量,尽可能发掘miRNA靶标

测序类型:大样本量外泌体miRNA测序
将测序大数据与统计学结合运用;
鉴定出的外泌体miR-30d-5p和let-7d-3p是用于宫颈癌及癌前病变非侵入性筛查的诊断生物标志物。它也可以被纳入常规的血液检查中,从而减少检查时间。

实验结果

研究路线

结论:外泌体let-7d-3p和miR-30d-5p作为诊断标志物,用于宫颈癌及其癌前病变的非侵入性筛查。

案例二 功能研究:肝细胞外囊泡miRNA-1促进内皮炎症和动脉粥样硬化的形成

发表期刊:Journal of Hepatology(IF:18.946)   
应用技术:
miRNA测序

一、研究背景

动脉粥样硬化被认为是由脂质异常积累和血管内皮内炎性细胞浸润引起的慢性炎性代谢疾病。人们认为,启动动脉粥样硬化的第一步是内皮损伤和功能障碍。临床证据和实验数据表明,NAFLD、内皮功能障碍与CVD之间存在密切的联系,而其潜在机制尚待阐明。
1)源自脂肪肝细胞的细胞外囊泡(EVs)是内皮炎症的有效诱导剂,在肝脏与脉管系统之间的远距离通讯中起关键作用
2)MicroRNA-1(miR-1)对内皮细胞的作用是通过抑制KLF4和激活NF-κB介导的;
3)抑制miR-1可以显著减少内皮炎症并减弱动脉粥样硬化;
4)肝细胞衍生的EV

二、研究思路

实验结论:肝细胞来源的EVs通过microRNA-1下调KLF4并激活NF-κB通路来促进内皮炎症和动脉粥样硬化的发生。揭示了肝脏与血管之间远距离通讯的新机制,以及预防和治疗NAFLD患者的新方法。

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