泛基因组测序

产品介绍常见问题经典案例结果展示


泛基因组研究,探秘物种间潜在密码。

泛基因组包括核心基因组(Core genome)和非必须基因组(Dispensable genome)。
其中,核心基因组由所有样本中都存在的序列组成,
一般与物种生物学功能和主要表型特征相关,反映了物种的稳定性;
非必须基因组由仅在单个样本或部分样本中存在的序列组成,一般与物种对特定环境的适应性或特有的生物学
特征相关,反映了物种的特性。针对不同但又相互关联的个体材料进行较高深度测序,
单独进行组装,构建泛基因组图谱,以期获得该物种完整的遗传信息。

因材而为,挖掘品种特异性。

选择不同亚种的材料:可以研究物种的起源及演化等重要生物学问题;
选择野生种和栽培种等不同特性的种质资源:可以发掘重要性状相关的基因资源,为科学育种提供指导;
选择不同生态地理类型的种质资源(不同世系):可以开展物种的适应性进化,外来物种入侵性等热门科学问题的
研究,为分子生态学等学科提供新的研究手段。

科学方案设计

从材料选取,建库测序,到数据分析,
每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。

物种基因组特点 简单基因组 复杂基因组 超复杂基因组
低指标组装 高指标组装 低指标组装 高指标组装 低指标组装 高指标组装
测序策略 50×PacBio/Nanopore
+100×Illumina
80×PacBio/Nanopore
+100×Illumina
50×PacBio/Nanopore
+100×Illumina
100×PacBio/Nanopore
+100×Illumina
50×PacBio/Nanopore
+100×Illumina
100×PacBio/Nanopore
+100×Illumina
组装指标 哺乳动物&鸟:
contigN50>1 Mb;
其他简单基因组:
contigN50>500 Kb
哺乳动物&鸟:
contigN50>3 Mb;
其他简单基因组:
contigN50>2 Mb
哺乳动物&鸟:
contigN50>300 Kb;
其他简单基因组:
contigN50>100 Kb
哺乳动物&鸟:
contigN50>2 Mb;
其他简单基因组:
contigN50>500 Kb
contigN50>100 Kb contigN50>100 Kb

信息分析

泛基因组测序是对多个物种进行低/高深度的测序、组装和注释,
通过构建泛基因组图谱,可得到这个物种的全部基因。同时还可
对多个品种进行比较分析,挖掘品种特有的基因以及变异位点,这
些变异位点以及特有基因往往与物种特有的生物学功能有关。

出色完成每一个项目环节

自2014年诺禾致源在Nat Biotechnol上发表大豆泛基因组研究成果以来,诺禾致源的基
因组合作项目遍布全球,引领基因组研究潮流。泛基因组研究覆盖样本更为广泛、研究更为
全面和彻底,并具有各自的数据挖掘亮点,为大范围的物种进化和育种研究提供了坚实有力
的支撑,具有重要意义。

一对一业务咨询

一对一业务咨询

在线客服

联系方式

联系电话

400-658-1585

企业邮箱

service@novogene.com
返回顶部