表观组学(染色质微环境)-项目案例-诺禾致源

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表观组学(染色质微环境)

项目案例一

A fast chemical reprogramming system promotes cell identity transition through a diapause-like state

期刊：Nature Cell Biology
影响因子：21.3

细胞重编程（将已分化的体细胞逆转为诱导多能干细胞（Induced pluripotent stem cell, iPSC））利用过表达转录因子或使用化学小分子组合等策略实现细胞命运转换，在疾病模型、药物筛选和再生医学中具有广泛应用前景。本研究通过大规模的化学分子筛选，建立了快速化学重编程系统（FCR），其快速的动力学和高效率大大加快了细胞重编程的过程，为细胞重编程全面特征和分子机制提供了独特见解。

本篇研究发明的FCR化学重编程系统独特地过渡到滞育类状态，快速完成细胞的“返老还童”。更有趣的是，异染色质修饰蛋白H3K9me3在FCR过程中通过调控iPSC相关的ERVs的表达，参与了细胞转录组和表观遗传组的重塑，从而推动了细胞命运转换。这一研究结果完善了细胞重编程机制以及在干细胞研究和再生医学方面具有广泛的应用前景。

项目案例二

Infection phase-dependent dynamics of the viral and host N6-methyladenosine epitranscriptome in the lifecycle of an oncogenic virus in vivo

期刊：Journal of Medical Virology
影响因子：20.69
发表时间：2022年11月

N6-腺苷酸甲基化（m6A）是真核生物和病毒中较常见的mRNA修饰方式，一旦参与m6A修饰的酶出现异常将会引起一系列疾病，包括但不限于肿瘤、神经性疾病、胚胎发育迟缓等。研究表明：m6A甲基化在致癌病毒复制中发挥关键调控作用^[3]。然而由于缺乏合适的动物模型，在宿主体内的调控作用机制尚不清楚。

本研究利用MDV感染动物模型分析了不同感染阶段病毒和宿主转录组m6A修饰变化，发现m6A修饰参与调控病毒复制和致肿瘤过程。具体而言，甲基化转移酶METTL3/14复合物在MDV生命周期的裂解和再激活阶段被抑制，而在潜伏阶段和MDV诱导的肿瘤中其表达增加。METTL3/14过表达抑制MDV基因表达和复制，而METTL3/114敲低则增强MDV基因的表达和复制。这些发现揭示了病毒体内复制过程中m6A修饰程序的动态特征，特别是与肿瘤发生相关的关键途径。

参考文献

[1] Chen X, Lu Y, Wang L, et al. A fast chemical reprogramming system promotes cell identity transition through a diapause-like state[J]. Nat Cell Biol, 2023.

[2] Zhuang G, Zhao X, et al. Infection phase-dependent dynamics of the viral and host N6-methyladenosine epitranscriptome in the lifecycle of an oncogenic virus in vivo[J]. J Med Virol. 2023, 95(1):e28324.

[3] Tsai, K., & Cullen, B. R. (2020). Epigenetic and epitranscriptomic regulation of viral replication. Nature Reviews Microbiology. doi:10.1038/s41579-020-0382-3.