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多组学联合分析

转录调控和蛋白多组学

外泌体多组学

外泌体中 RNA 和蛋白质含量丰富,其中,RNA 包括非编码 RNA(smallRNA、lncRNA、cir-cRNA)与编码 RNA (mRNA),他们在细胞间起着信息传递、调控基因表达的重要作用。蛋 白质是功能的执行者,外泌体蛋白质组学在机体先天免疫疾病标志物筛选和药物靶点研究 中起着重要作用。

分析思路

研究方向

转录组 / 蛋白质组联合分析,揭示外泌体内容物、表面标志物特征与异质性,区分外泌体亚 型,探究细胞间信息传递机制,鉴定并筛选主要功能分子作为药物研究、辅助诊断、分子功 能靶点。

全转录组及翻译组联合分析

RNA 翻译成蛋白质的过程不是简单的遗传信息的传递,而是经过精确地翻译调控后生成 特定序列和结构的蛋白质。翻译组测序 Ribosome Profifiling(或称 Ribo-seq)是针对与 核糖体结合,长度约为 30nt,正在翻译的 mRNA 片段进行富集、测序和定量。据此获取每 种转录本上核糖体的分布,并可推测起始密码子位置 ( 包括非 ATG 起始 ) 以及 uORFs,分 析翻译效率,解析翻译调控机制。

分析思路

研究方向

转录组 / 翻译组联合分析,揭示 mRNA 翻译效率,非编码 RNA 可靠的 sORF。在翻译层面 解释翻译组与蛋白组数据的衔接机制,如翻译效率下降而转录本水平不变导致的蛋白水平8 下降。鉴定非编码 RNA,尤其是 lncRNA 中可靠的小开放阅读框 sORF,为预测其编码小肽 提供指导方向。

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