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质谱分析

4D Label-free定量蛋白质组

4D Label-free定量蛋白质组基于timsTOF Pro2质谱仪,在传统三维数据(保留时间、质荷比、离子强度)的基础上增加了第四个维度,离子淌度的信息,离子淌度概念的引入使得蛋白质组学进入4D新时代。

技术原理

timsTOF Pro创新性地使用了双TIMS分离/富集装置,离子在第一个TIMS部分中进行累积,然后在第二个TIMS中根据淌度进行分离,经过分离后的离子继续用于MS/MS碎裂。随后重复该步骤,在该过程中,当第二个TIMS进行分离时,第一个TIMS也同时在平行地累积离子,这样可以实现近乎100%的离子利用率。

技术优势

相较于传统Label-free蛋白质组,4D Label-free蛋白质组检测深度更高,需求样本量更少,离子利用率高,在谱图预处理方面,4D-LFQ能够根据离子淌度和m/z特征去除掉单电荷离子从而减少共流出效应。

技术路线

信息分析流程

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