基因组测序>
建库测序>
人类基因组测序>
动植物基因组测序>
微生物基因组测序>
转录调控测序>
表观组测序>
单细胞测序>
空间转录组>
基因分型>
质谱分析>
蛋白组学分析>
代谢组学分析>
免疫定量>
转化医学>
转化医学及临床试验服务>
伴随诊断一站式解决方案>
多组学联合分析>
Peak 注释
peak相对TSS的分布
为研究 TSS 侧翼的开放性程度,我们根据其与 peak 的距离,统 计 TSS 临近区域的peak 分布情况。peak在功能区域上的分布
使用 ChIPseeker 对 peak 在基因组不同功能区域(promoter、5’UTR、3’UTR、 Exon、Intron、Downstream、Intergenic)上的分布进行注释和统计。聚类分析
基于ATAC的peak信号,可对细胞进行聚类分析,然后通过t-SNE对样本进行降维、可视化,展示细胞的分群情况。Maker基因展示
通过聚类分析得到的各cluster中差异高表达的基因,针对这些特征性marker基因以多种形式进行展示。Motif注释分析
将鉴定到的染色质开放位点同转录因子数据库JASPAR关联,可对cluster的每个Motif进行注释,然后把Motif注释结果投射到t-sne细胞分群图。可以把cluster差异motif,在t-SNE分群图中可视化,展示Motif活性信号。Copyright@2011-2023 All Rights Reserved 版权所有:北京诺禾致源科技股份有限公司 京ICP备15007085号-1