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送样建议

三代建库测序服务

1. 三代微生物

  • 1.1 单菌组织样本(细菌,真菌)

    • (1)样本量:菌体≥3g,-80℃保存,干冰寄送。
      (2)样本准备:对数期细菌(50ml)菌液,4000×g 离心 10min(4℃),弃上清,沉淀(离心后至少3g)用无菌水洗 2 次后干冰送样,建议送 2-3个平行,避免一次提取不成功。
      真菌(100mL)菌液,4000×g 离心 10min(4℃),弃上清,沉淀用无菌水 洗 2 次后干冰送样,若是新鲜真菌建议 3g 以上,建议送 2-3个平行,避免一次 提取不成功。
      (3)提取成功的样品类型:鲍曼不动杆菌,沃氏葡萄球菌,肠炎沙门氏菌,埃希氏菌,粪肠球菌,葡萄球菌,不动杆菌,放线菌,链霉菌等。
      (4)注意事项:
      a)甘油保存,需要重新液体培养基(例如 LB)活化到对数期,不可直接送甘油保存的菌株;
      b)不建议送固体培养皿的菌,如是只有固体培养基才能活,可以刮到有 PB 缓冲液的离心管里面,离心,送沉淀 2g 以上;
      c)真菌(5g)大型菇类等,建议送菌丝,不建议送孢子或是子实体,杂合率较高,不利于组装;
      d)样本一定为非灭活样本,灭活会导致核酸严重降解。
  • 1.2 三代扩增子组织样本

    • (1)样本量:
      样本类型 建议送样量 最低送样量
      土壤/污泥/沉积物/腐殖质 3-5g 1g
      水体滤膜 (孔径0.22-0.45μm/直径3-4cm) 2-3张 1张
      拭子 3-5个 1个
      瘤胃液/发酵液/组织液 (离心有明显沉淀) 3-5mL 1mL
      粪便/肠道内容物 3-5g 1g
      动物/人组织 1-3g 1g
      血浆 3-5mL 1mL
      (2)样本运输:-80℃保存,干冰寄送。
      (3)提取成功的样品类型
      样本类型 建议送样量 最低送样量
      土壤/污泥/沉积物/腐殖质 3-5g 1g
      水体滤膜 (孔径0.22-0.45μm/直径3-4cm) 2-3张 1张
      拭子 3-5个 1个
      瘤胃液/发酵液/组织液 (离心有明显沉淀) 3-5mL 1mL
      粪便/肠道内容物 3-5g 1g
      动物/人组织 1-3g 1g
      血浆 3-5mL 1mL

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