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质谱分析

定量蛋白质组技术比较

iTRAQ和TMT是分别由美国AB Sciex公司和Thermo公司研发的多肽体外标记定量技术, 采用8种或18种同位素标签,通过特异性标记多肽的氨基酸基团, 一次上机可实现8种或18种不同样本中蛋白质的相对定量,是近年来定量蛋白质组学常用的高通量筛选技术。

技术类型 是否标记 数据扫描模式 技术特点
TMT 是,多样本上机 DDA 定量准确,重复性好,不可比较有无蛋白,适用于同一物种同一组织共有蛋白差异比较,定量值存在压缩效应
iTRAQ
Label-free 否,多样本上机 DDA 适用范围广泛,成本较低,可用于“有无蛋白”比较,定量准确性和重复性不高
4D Label-free 否,多样本上机 DDA 扫描速度快、灵敏度高,检测深度高,需求样本量少,可获取CCS
DIA 否,多样本上机 DDA(建库) 蛋白覆盖度高,定量准确,重现性高,适用于大样本,样本少时成本较高
否,单样本上机 DIA
4D DIA 否,多样本上机 DDA(建库) 1. 近乎100%的离子利用率,提升检测灵敏度;
2. 更高的检测深度和覆盖度;
3. 定量重复性、完整性、可靠性全面提升。
否,单样本上机 DIA
Deep DIA(Astral) 否,单样本上机 DIA 深覆盖、高准确、超快速,蛋白鉴定深度较传统定量技术提高了30%以上;机时更短,速度更快,周期更短;无损轨道分辨率更高。
高深度血液蛋白质组 否,单样本上机 DIA 针对不同物种的血液样本,可以达到更多样本检出

定量蛋白质组技术参数

产品 质谱平台 项目经验 周期
TMT/iTRAQ Thermo Q ExactiveTM
HF-X/Orbitrap
Exploris 480
蛋白鉴定数目6000以上 30个自然日
Label-free Thermo Q ExactiveTM
HF-X/Orbitrap
Exploris 480
蛋白鉴定数目3000以上 30个自然日
4D Label-free Bruker tims TOF Pro 2 蛋白鉴定数目6000以上 30个自然日
DIA Thermo Q ExactiveTM
HF-X/Orbitrap
Exploris 480
蛋白鉴定数目6000以上 30个自然日
4D DIA Bruker tims TOF Pro 2 蛋白鉴定数目6000以上 30个自然日
Deep DIA(Astral) Orbitrap Astral 蛋白鉴定数目10000以上 15个自然日
*注: 具体样本是否可承诺指标,请致电咨询。

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