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多组学联合分析
生物中“基因组到转录组、蛋白质组再到代谢组”的遗传传递过程遵循经典的中心法则,但中心法则并不能全面解释其中复杂的遗传调控过程,包括各种类型的基因表达调控过程,基因甲基化水平的变化,以及 RNA 可变剪切等等。在任何的基因组、甲基化组、转录组、蛋白组、代谢组中产生的细微差异都有可能会对个体表型产生不可估量的影响。动植物多组学以基因组为基础,同时联合其他不同类型组学数据对动植物样本进行系统研究,可以深入挖掘生物功能信息,有助于全面掲示复杂的分子遗传调控机制。

分析思路

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应用方向

  • 基因组:

    获得物种基因组组装注释结果,采用比较基因组学或全基因组重测序等方法分析物种遗传变异信息。
  • 转录组:

    分析差异表达基因、可变剪切位点等,在转录组水平验证基因变异导致的基因表达差异及转录本变化,从基因调控与基因功能方面联合解决生物学问题。
  • 代谢组:

    代谢物含量差异分析,将代谢产物定性定量后结合表型数据、候选位点信息等其他组学数据,多维度解析物种多样性遗传变异。
  • 蛋白质组:

    蛋白质含量差异分析,将蛋白质定性定量后结合表型数据、候选位点信息等其它组学数据,多维度解析物种多样性遗传变异。
  • 表观组:

    甲基化位点与差异甲基化分析,将甲基化数量性状位点与目标基因关联分析,进一步筛选候选位点。
  • 联合分析:

    不同组学水平的数据整合进行关联分析,不同纬度阐明生物体细胞生命过程,获取从细胞到个体的动态变化情况,助力研究物种复杂性状的调控与遗传机制。

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